AI технологии в транскриптомике единичных клеток

Семестр: 3  |  Часы: 72  |  Зачётные единицы: 2

Краткое описание

Курс для знакомства обучающихся с концепцией применения ИИ-технологий в анализе транскриптомных данных единичных клеток.

Кто ведёт

Тычинин Д. И.

Содержание

1. Базовая сборка scRNA-seq AnnData объекта со стороны используемых методов машинного обучения

• Применяемые методы машинного обучения при сборке AnnData объекта.

2. Методы глубокого обучения, применение моделей на данных транскриптомики единичных клеток

• Нейросети, принцип работы и возможные архитектуры.
• Применение нейронных сетей в задачах анализа транскриптомики единичных клеток.

3. Применение изученных методов в реальных задачах анализа транскриптомики единичных клеток.

• Клеточное аннотирование.
• Оценка композиционных и функциональных различий, на основании данных scRNA-seq.
• Лиганд-рецепторные взаимодействия.
• Модели генных регуляторных сетей в технологии секвенирования единичных клеток.