Анализ транскриптомных данных

Семестр: 2  |  Часы: 108  |  Зачётные единицы: 3

Краткое описание

Вводный курс для знакомства обучающихся с концепцией анализа транскриптомных данных.

Кто ведёт

Ямщиков П. С.

Содержание

1. Основы высокопроизводительного РНК-секвенирования

• Введение в транскриптомику.
• Библиотеки РНК-секвенирования.

2. Первичный анализ транскриптомных данных

• Выходные данные РНК-секвенирования.
• Контроль качества.
• Выравнивание прочтений.
• Подсчет прочтений на индивидуальные гены.

3. Сравнительный анализ транскриптомных данных

• Разведочный анализ данных.
• Анализ дифференциальной экспрессии генов.
• Функциональная аннотация генов.

4. Визуализация и работа с экспериментальными данными

• Визуализации результатов анализа.
• Особенности анализа экспериментальных данных.
• Работа с низкокачественными данными.